針對四川地震災區疫情問題，大陸衛生部公布「抗震救災衛生防疫工作方案」，明確指出全面展開災區公共衛生和傳染病防控工作。

由於災區挖出的屍體已發出屍臭，方案要求對屍體要及時就地清理，盡快掩埋；必須辨明身分不能馬上處理者，存放時間應盡量縮短。

在城鎮、村外選擇理想的埋屍地點，在便於運輸又在不影響城鎮、村容。埋葬地點必須遠離水源地，儘量選擇在人口密集區的下風處。屍體進行清理後，需要對其場所進行消毒處理，可選用漂白粉液噴灑。

衛生防疫工作方案要求劃出一定範圍水源保護區，制止在此區域排放糞便、汙水與垃圾。

方案說，將水煮沸，是十分有效的滅菌方法，在有燃料的地方可採用；災害期間最主要的飲水消毒方法，是採用消毒劑滅菌。方案並要求，要有專人負責做好殺蟲滅鼠藥物的集中供應、配製和分發等工作。