國務機要費案自陳水扁以總統特權將卷證資料核定為「絕對機密」後，近一年來不論偵審都陷入困境；在一、二審都認為陳水扁的核定於法不合後，正是馬英九總統重新檢視是否應解密或降密，以利後續司法程序的好時機。

國務機要費案爆發之初，陳水扁為顯示坦蕩表態願接受檢方調查，並提出外交機密用途的說法。然而在法院對馬永成、林德訓等人即將審結之際，他卻突襲性地將所有發票、筆錄等眾所周知事實，以總統特權全部核定為絕對機密，並下令永不得公開。

一審法院裁定便指出，陳水扁的核定是有意為隱瞞違法及掩飾不名譽，且發票等證據早經總統府及立委等多人過目，審理中不但律師影印、還在法庭上公開勘驗，已毫無機密可言，陳水扁所為，是干擾訴訟。

如此明確的事實，馬英九在上任總統之初，或許基於政治考量，不便以總統特權解密，結果卻是協助陳水扁持續利用抗告等訴訟程序，拖延司法偵、審的進行。

馬英九總統不應再迴避，即使全案部分內容牽涉到外交機密，也可用「降密」方式便利偵審後續作為，對於發票、相關人員筆錄，更可順勢解密，以供公眾檢驗。